Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms