Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC107Q8WV48 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms