Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ZNF548Q8NEK5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ZNF548Q8NEK5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ZNF548Q8NEK5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ZNF548Q8NEK5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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