Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms