Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLD3Q8IV08 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms