Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms