Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APTXQ7Z2E3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms