Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms