Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms