Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIAT1Q6ZQX7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms