Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms