Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG9BQ674R7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms