Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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