Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXO43Q4G163 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms