Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A52Q3SY17 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms