Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms