Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CA9Q16790 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CA9Q16790 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CA9Q16790 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms