Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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