Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZIC1Q15915 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms