Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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