Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUM3Q15397 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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