Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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