Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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GPNMBQ14956 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPNMBQ14956 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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GPNMBQ14956 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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