Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LBRQ14739 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LBRQ14739 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms