Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL4Q14135 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL4Q14135 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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