Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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