Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CUL4AQ13619 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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