Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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