Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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