Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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