Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms