Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms