Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLEQ07864 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLEQ07864 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLEQ07864 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms