Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX2Q04743 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms