Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms