Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms