Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S2P59780 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S2P59780 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S2P59780 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP3S2P59780 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP3S2P59780 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms