Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO3P55854 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms