Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLTPP55058 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLTPP55058 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLTPP55058 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLTPP55058 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms