Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms