Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms