Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRE11P49959 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRE11P49959 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRE11P49959 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms