Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms