Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms