Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF2P35240 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF2P35240 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF2P35240 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF2P35240 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF2P35240 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF2P35240 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF2P35240 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF2P35240 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF2P35240 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NF2P35240 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NF2P35240 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NF2P35240 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NF2P35240 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NF2P35240 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NF2P35240 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NF2P35240 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms