Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM5P33992 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM5P33992 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM5P33992 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM5P33992 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM5P33992 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms