Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB2P29033 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB2P29033 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB2P29033 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms