Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNNI3P19429 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms