Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA4P13612 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms