Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms